某天，毛利偵探事務(wù)所接到了知名舞臺(tái)劇女演員牧樹里的委托。委托內(nèi)容是牧樹里收到怪盜基德預(yù)告信，信中指出怪盜基德將在舞臺(tái)上奪取牧樹里佩帶的藍(lán)寶石戒指“命運(yùn)的寶石”。于是毛利小五郎接受保護(hù)寶石的工作，依據(jù)毛利小五郎的推理，基德將在演出的最后一天前來(lái)盜取這顆無(wú)價(jià)的寶石。在演出的最后一天，毛利小五郎、小蘭和柯南受邀觀賞舞臺(tái)劇，在劇場(chǎng)里錯(cuò)綜復(fù)雜的人群中，基德到底會(huì)假扮成誰(shuí)出現(xiàn)在大家面前，在緊張的埋伏等候中，出現(xiàn)在大家面前的竟然是工藤新一，柯南一方面必須保護(hù)寶石，另一方面又不能拆穿基德假扮的工藤新一，因?yàn)椴鸫┗戮偷扔诠_自己身體縮小的秘密。柯南只好盯緊假的工藤新一，一刻都不能松懈。就在舞臺(tái)劇即將落幕之前，柯南發(fā)現(xiàn)假的工藤新一不見了，隨即追上，但卻在一片混亂之中讓基德逃脫了。不過，“命運(yùn)的寶石”終究是保護(hù)住了，牧樹里為了表示感謝，邀請(qǐng)毛利偵探前往北海道函館的別墅度假，同行的還有一同演出的其他演員。就在大家都搭上飛機(jī)前往函館的機(jī)艙時(shí)，一幕精心設(shè)計(jì)的殺人劇就在大家面前上演了。柯南除了要防止基德再度混入人群中，又要解開發(fā)生在飛機(jī)上的密室殺人事件，到底柯南要怎么行動(dòng)呢？

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